במוטציה שקטה אין שינוי ברמת החלבון.
למוטציה זו אין השפעה ברמת הפנוטיפ על הפרט הבודד מכיוון שהיא
משנה את זה לקודון אחר שמקדד את אותה חומצה אמינית.
הרבה פעמים המוטציה נקודתית היא רצסיבית, אז צריך שזה יבוא
משני ההורים כדי שזה יפעל.
לדוגמה: AGG à CGG. שני
קודונים אלה מקודדים לחומצה האמינית Argenine. (נשים לב שהחלפנו את הנוקליאוטיד A,
שהוא פורין, בנוקליאוטיד C, שהוא פירי מידין. על כן זוהי מוטציית Transversion).