Base Excision Repair – BER


 תהליך EMS - אתילציה לבסיס. תהליך MMS - מתילציה לבסיס.

מערכת זו יכולה לתקן בסיסים שעברו התמרה. בתחילה המערכת מסירה את הבסיס ומשאירה שלד סוכרי. מערכת נוספת יוצרת שבר חד-גדילי, מחליפה את הבסיס ו-DNA-Ligase מתקן את השבר.



מנגנון פעולה

AP - A-pourinic site או A-pyrimidinic site. מצב בו חסר בסיס אחד.

המערכת צריכה להתמודד עם המצב:

1.     Glycosylase – חותך את הבסיס ומשאיר אתר AP.

2.     Endonuclease – מגיע ל-AP וחותך בתוכו (Endo – חותך מאמצע הגדיל), כך שנשאר שבר חד-גדילי.

3.     Exonuclease – מגיע לקצה השבר ומתחיל לעכל משם (Exo – מבצע חיתוך מקצה פתוח של DNA). אורך העיכול – עד 12 בסיסים.

4.     Pol-beta – מסנתז מחדש את מקטע ה-DNA.

5.     DNA-Ligase – סוגר את השבר החד-גדילי.

 

ישנם שני מסלולים מאוד קרובים בתיקון זה - הסרה של מקטעים קצרים והסרה של מקטעים ארוכים (לא נפרט על ההבדלים).

חשיבות מנגנון זה היא עצומה - במידה ומסירים מעכברים את החלבון Pol-beta העכברים ימותו בתור עוברים.