יש אותיות שאומרות שקודון נגמר, ואם פתאום יש כזה באמצע קודון
רק חצי חלבון משתחרר, בד"כ זה יגרום לכך שהתא לא יוכל להשתמש בחלבון הזה, ואם
זה חלבון חשוב זה בעייתי.
החלפת קודון של חומצה אמינית ב-Stop Codon.
בעקבות כך החלבון מתקצר, וההשפעה של קיצור זה תלויה במיקום בו הגיע ה-Stop Codon:
יכול להיות שהחלבון יתפקד באם האתר הקטליטי כבר נוצר, אם הקצה ה-C
טרמינלי חשוב לפעילות או שהחיתוך נעשה במרכז החלבון, כמעט תמיד נקבל חלבון פגום.
לדוגמה: CAG à UAG –
החלפת Glutamine ב-Stop Codon.